Elimina módulos, refactoriza parte de Atlas

Borra módulos LayersManager y LayersTree. No está claro de dónde venían,
ya que son anteriores al comienzo del repositorio git actual. A día de
hoy no parece que hicieran nada ni que estuviera previsto. Quizá fue un
intento de refactorizar Atlas.

Implementa gestión de leyendas como base de módulo Atlas, para aligerar
su código.

Reubica módulo Atlas y extensiones relacionadas, actualiza referencias.